Kalifornijos universiteto San Diege mokslininkai pasitelk\u0117 dirbtin\u012f intelekt\u0105, kad itin tiksliai i\u0161\u0161ifruot\u0173 vadinam\u0105j\u012f inicijatori\u0173 DNR sekoje. Tai molekulinis jungiklis, esantis vietoje, nuo kurios pradedamas gen\u0173 nuskaitymas, ir, kaip rodo naujas vertinimas, aptinkamas ma\u017edaug 60 proc. vadinam\u0173j\u0173 \u201esusitelkusi\u0173\u201c \u017emogaus promotori\u0173.<\/p>\n
Tyrimo rezultatai paskelbti mokslo \u017eurnale \u201eGenes & Development\u201c. Autori\u0173 teigimu, \u0161is darbas suteikia \u012frank\u012f geriau prognozuoti, ar konkreti mutacija reguliacin\u0117je DNR dalyje gali sutrikdyti gen\u0173 \u012fjungim\u0105 ir prisid\u0117ti prie lig\u0173, \u012fskaitant onkologines, vystymosi.<\/p>\n
Inicijatorius yra seka promotoriaus srityje, netoli vadinamosios +1 pozicijos, kur prasideda transkripcija, kai genetin\u0117 informacija perra\u0161oma \u012f RNR. Nors \u0161is elementas \u017einomas seniai, iki \u0161iol jo \u201etaisykli\u0173 rinkinys\u201c \u017emogaus genome nebuvo pakankamai tikslus, kad leist\u0173 patikimai vertinti atskir\u0173 mutacij\u0173 pasekmes.<\/p>\n
Ankstesni darbai inicijatori\u0173 siejo su ma\u017edaug 40\u201349 proc. susitelkusi\u0173 promotori\u0173, ta\u010diau naujas DI pagr\u012fstas modeliavimas \u0161\u012f skai\u010di\u0173 padidino iki ma\u017edaug 60 proc. Tai svarbu, nes susitelk\u0119 promotoriai da\u017enai valdo vystymosi, signal\u0173 perdavimo ir audiniams b\u016bdingus genus, kuri\u0173 reguliacijos sutrikimai gali tur\u0117ti didel\u0119 biologin\u0119 kain\u0105.<\/p>\n
Komanda suk\u016br\u0117 apie 500 000 skirting\u0173 DNR variacij\u0173 inicijatoriaus regione ir laboratorijoje i\u0161matavo kiekvienos j\u0173 transkripcin\u012f aktyvum\u0105. \u0160ie duomenys panaudoti apmokyti modeliui, kuris \u012fvertina, kaip skirtingos nukleotid\u0173 kombinacijos veikia geno \u201e\u012fjungimo\u201c stiprum\u0105.<\/p>\n
V\u0117liau modelis leido apskai\u010diuoti prognozuojam\u0105 aktyvum\u0105 visoms 1 048 576 galimoms 10 nukleotid\u0173 kombinacijoms. Tokia apimtis suteikia galimyb\u0119 ne tik apra\u0161yti \u201evidutin\u0119\u201c sek\u0105, bet ir \u012fvertinti net subtili\u0173 vieno simbolio pakitim\u0173 \u012ftak\u0105 gen\u0173 rai\u0161kai.<\/p>\n
\u201eDI modeliams pirm\u0105 kart\u0105 pavyko pateikti stiprias prognozes, ar inicijatorius \u017emogaus genuose bus, ar jo nebus, ir taip i\u0161koduoti inicijatoriaus DNR sekos ra\u0161t\u0105\u201c, \u2013 sak\u0117 vienas i\u0161 tyrimo autori\u0173, profesorius Jamesas T. Kadonaga.<\/p>\n
Dalis v\u0117\u017eio rizik\u0105 didinan\u010di\u0173 poky\u010di\u0173 slypi ne pa\u010diuose baltymus koduojan\u010diuose genuose, o reguliacin\u0117se srityse, kurios nusprend\u017eia, kada genas turi veikti ir kokiu intensyvumu. \u012erankis, galintis kiekybi\u0161kai \u012fvertinti toki\u0173 reguliacini\u0173 mutacij\u0173 poveik\u012f, gali pagerinti j\u0173 interpretacij\u0105 ir pad\u0117ti atskirti reik\u0161mingus pakitimus nuo neutrali\u0173.<\/p>\n
Mokslininkai taip pat prane\u0161a aptik\u0119 anks\u010diau neapra\u0161yt\u0105 inicijatoriaus tip\u0105, susijus\u012f su TATA seka, kuri, kaip nurodoma, b\u016bdinga ma\u017edaug 24 proc. promotori\u0173. Be to, pasteb\u0117ta ry\u0161ki s\u0105veika tarp inicijatoriaus ir kito promotoriaus regiono, o palyginimas su vaisine musele parod\u0117, kad inicijatoriaus ra\u0161tas per evoliucij\u0105 i\u0161liko beveik nepakit\u0119s.<\/p>\n
\u201eGalutinis \u0161io darbo tikslas yra \u017eengti dar vien\u0105 \u017eingsn\u012f \u012f priek\u012f, sujungiant laboratorinius eksperimentus ir dirbtin\u012f intelekt\u0105, kad i\u0161 DNR sekos b\u016bt\u0173 perskaityta joje u\u017ekoduota informacija\u201c, \u2013 teig\u0117 profesorius Jamesas T. Kadonaga.<\/p>\n
Pasak UCSD komandos, tolesnis u\u017edavinys yra i\u0161tirti likusi\u0105 dal\u012f susitelkusi\u0173 promotori\u0173, kuriuose dar n\u0117ra ai\u0161kiai identifikuot\u0173 \u017einom\u0173 reguliacini\u0173 element\u0173. Tokie darbai siejami su platesne kryptimi, kurioje DI taikomas ne tik gen\u0173 variant\u0173 paie\u0161kai, bet ir tam, kad b\u016bt\u0173 galima prognozuoti j\u0173 funkcines pasekmes skirtinguose biologiniuose kontekstuose.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Kalifornijos universiteto San Diege komanda su DI tiksliai i\u0161\u0161ifravo DNR inicijatori\u0173 ir \u017eada geriau numatyti, kurios mutacijos gali sutrikdyti gen\u0173 \u012fjungim\u0105.<\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":50357,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[7],"tags":[102,28399,12858,38901,3160,38902,2066],"miestas":[],"class_list":["post-50356","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-technologijos","tag-dirbtinis-intelektas","tag-dnr","tag-genetines-mutacijos","tag-genu-raiska","tag-kalifornijos-universitetas-san-diege","tag-promotoriai","tag-vezys"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50356","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50356"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50356\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media\/50357"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50356"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=50356"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=50356"},{"taxonomy":"miestas","embeddable":true,"href":"https:\/\/cp.snarskis.lt\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/miestas?post=50356"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}